Keunggulan Program Studi Doktor Manajemen Universitas Muhammadiyah Yogyakarta adalah mengintegrasikan ilmu pengetahuan, seni, dan teknologi dalam bidang Manajemen dengan Al-Islam dan Kemuhammadiyahan. Dengan demikian, alumni Program Doktor Manajemen UMY mampu menjawab tantangan Bisnis dan Manajemen di era disrupsi humanistik pada revolusi industri 4.0.